שינויי האקלים זוכים לתשומת לב עולמית בגלל ההשלכות הסביבתיות, הכלכליות והחברתיות שיש להם על העולם המפותח והמתפתח.
מחקרי מוסד שמואל נאמן בתחום זה כוללים התייחסות להפחתת פליטות גזי חממה (מיטיגציה) ותכליתם תיאור וניתוח הפליטות ומתן בסיס מדעי לגיבוש מדיניות לאומית בתחומים השונים, בהם – הפקת אנרגיה, תחבורה, תעשייה, בנייה, חקלאות, מים ועוד.
צוות מוסד נאמן מנהל בעבור המשרד להגנת הסביבה את המערך לדיווח ורישום פליטות גזי חממה. מערך הדיווח, אשר מופעל מאז שנת 2010, הינו וולונטרי אולם כפוף לקריטריונים ולשיטות אשר פותחו על ידי המשרד להגנת הסביבה ומוסד שמואל נאמן, בשיתוף צוות עבודה שכלל נציגים מכל מגזרי המשק וגופים ממשלתיים שונים. קובץ אקסל מיוחד, אשר פותח ומעודכן כל שנה על ידי צוות מוסד שמואל נאמן, משמש ככלי עזר לכימות פליטות גזי חממה ותיעוד מצאי הפליטות של הגוף המדווח. סרטוני הדרכה למילוי טפסי הדיווח מופיעים באתר המשרד להגנת הסביבה. החל משנת 2017 מערך הדיווח מנוהל בשיתוף חברת אקוטריידרס.
סרטוני הדרכה להכנת קבצי דיווח וחישוב פליטות גזי חממה.
דיווח על פליטות גזי חממה בישראל: אמצעים לניהול צריכת אנרגיה .
פרויקט נוסף של מוסד נאמן עם המשרד להגנת הסביבה כלל ליווי של ועדת המנכ"לים הבין-משרדית, בראשות מנכ"ל משרד האוצר, מר חיים שני, שגיבשה במהלך שנת 2010 את התוכנית הלאומית להפחתת פליטות גזי חממה. וכן ראו מסמך סדרי עדיפות לאומית בנושא הטיפול בסוגיית גזי החממה.